原標題:古DNA技術(shù)有怎樣的發(fā)展
高通量測序,又叫“二代測序”,是一種快速測定大量DNA序列的技術(shù)。在高通量測序普及之前,古DNA領(lǐng)域只能依賴PCR技術(shù)測定少數(shù)特定DNA片段的序列。這種方法獲取的DNA信息極其有限,而且難以區(qū)分真正的古DNA和污染DNA。高通量測序理論上能測序樣本中所有DNA分子的信息,且成本逐年降低。即使是含量極低的古DNA,也能很有效地對其進行測序。不僅如此,通過生物信息學(xué)手段(如mapDamage軟件),我們還能快速檢測樣本中是否存在古DNA損傷,從而達到鑒別古DNA的目的。這一方法,也成了領(lǐng)域中古DNA檢測的重要標準。
盡管高通量測序已能較為有效地測序古DNA,但由于古DNA提取物中常常包含大量污染DNA,使得測序的大部分DNA分子都是無用的信息,真正有用的古DNA序列常常只占測序數(shù)據(jù)的1%不到。對此,研究人員在古DNA領(lǐng)域研發(fā)應(yīng)用了DNA捕獲技術(shù)——通過設(shè)計DNA或RNA探針,像釣魚一樣把目標古DNA從海量的污染DNA中“釣取”出來。這項技術(shù)廣泛應(yīng)用于人類古基因組研究中,目前超過2/3的人類古基因組數(shù)據(jù)來自一個叫“1240k”的探針組的捕獲數(shù)據(jù)。DNA捕獲技術(shù)不僅使得對古DNA的測序效率大大提高,還能有效從一些“棘手”的樣本中得到足夠的數(shù)據(jù)用以分析。
來源: 光明日報
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